技能库 1456 个
更多分类（146）
肿瘤免疫微环境细胞丰度推断
利用转录组数据通过CIBERSORTx、ESTIMATE或xCell等方法估算免疫细胞比例，以解析肿瘤免疫微环境组成。
肿瘤突变图谱分析
使用全外显子或全基因组测序数据识别体细胞突变、拷贝数变异及结构变异，并关联免疫浸润特征，支持精准医疗研究。
新抗原预测与免疫原性评估
基于肿瘤体细胞突变数据，预测MHC结合肽段，并筛选具有免疫原性的潜在新抗原，用于个性化疫苗设计或免疫治疗靶点发现。
单细胞RNA-seq免疫分析
处理10X Genomics单细胞转录组数据，执行聚类、免疫细胞注释及差异表达分析，聚焦肿瘤免疫微环境亚群。
免疫组库测序数据处理
从TCR/BCR测序数据中提取克隆型、多样性及V(D)J重排信息，支持肿瘤免疫基因组学研究中的精准医疗分析。
肿瘤突变负荷计算
从体细胞突变列表计算编码区突变密度，并标准化为每Mb突变数。
生存分析关联免疫特征
使用Cox回归或Kaplan-Meier方法评估免疫相关基因/特征与患者预后的关联，适用于肿瘤免疫基因组学研究。
免疫检查点基因表达分析
量化PD-L1、CTLA-4等免疫检查点基因表达，并比较肿瘤与正常组织差异
编辑效率评估
通过实验或计算模型评估不同基因编辑策略的效率，包括CRISPR/Cas9、碱基编辑器和先导编辑器等
载体构建流程自动化
自动化设计并生成用于基因编辑的质粒或病毒载体，提升实验效率与可重复性
编辑结果测序分析
分析Sanger或NGS测序数据以验证基因编辑结果，包括比对、突变识别和效率评估
文献数据提取
从基因编辑相关文献中系统提取关键实验参数、结果数据及技术细节，支持工具开发与优化
工具库调用脚本编写
编写Python脚本调用常用基因编辑分析工具库（如CRISPResso2、BEAT、MAGE等），实现自动化数据处理与结果输出
实验记录生成
自动生成标准化的基因编辑实验记录，涵盖实验设计、操作步骤、结果分析和质量控制，适用于基因编辑工具开发研究场景
guide RNA 设计
使用算法设计并优化CRISPR-Cas9等系统的引导RNA序列，以提高编辑效率和特异性。
脱靶效应预测
利用生物信息学工具预测和评估基因编辑的脱靶风险，为基因编辑工具开发提供安全性评估
交叉参考毒性文献检索
针对特定基因治疗产品，检索并总结同类产品的毒性数据，为临床前毒理评估提供文献支持。
监管文件毒理部分起草
根据模板自动填充IND/CTA申请中的毒理章节，确保内容符合监管要求并突出基因治疗产品特性
基因编辑脱靶风险分析
基于CRISPR脱靶预测软件输出并生成风险评估报告
毒理数据质量控制报告生成
自动检查基因治疗临床前毒理实验数据的完整性、异常值及GLP合规性，生成结构化质量控制报告。
临床前毒理报告摘要生成
从完整毒理报告中提取关键发现、NOAEL及安全性结论
毒理病理学图像初步分析
对基因治疗临床前毒理研究中的组织切片图像进行自动识别，标记潜在病变区域，辅助毒理学家快速筛查。
GLP毒理实验方案生成
根据FDA/ICH指南自动生成符合GLP标准的毒理实验方案，适用于基因治疗产品临床前评估。
AAV载体毒性数据库查询
从内部或公共数据库检索AAV血清型、剂量相关的毒性数据，支持基因治疗临床前毒理学评估