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多组学数据整合构建基因调控网络
整合转录组、表观组、蛋白质组等多模态数据，构建综合的基因调控网络模型，用于精准医疗中的调控机制解析与靶点发现。
ChIP-seq/ATAC-seq分析
处理染色质免疫共沉淀测序或ATAC-seq数据，鉴定转录因子结合位点和开放染色质区域
基因集富集分析
执行GO/KEGG等通路富集分析，解释基因列表的生物学功能，适用于基因调控网络研究与精准医疗场景。
基因调控网络推断
使用GENIE3、SCENIC等算法从表达数据推断转录因子-靶基因调控关系
单细胞转录组数据处理
处理10x Genomics等单细胞RNA-seq数据，进行质控、降维、聚类和差异表达分析，支持基因调控网络研究中的精准医疗场景。
调控网络动态建模
基于常微分方程或布尔网络构建基因调控网络的动态模型，模拟基因表达扰动与系统行为变化。
数据库查询与数据下载
从GEO、ENCODE、TCGA等公共数据库检索和下载基因表达及调控数据
生物信息学数据可视化
使用ggplot2、matplotlib等工具生成热图、网络图、火山图等可视化结果
CRISPR/Cas9基因编辑实验
设计sgRNA、构建编辑载体、细胞转染及编辑效率评估（T7E1、Sanger测序）
动物模型构建与给药
指导临床前基因疗法研究员进行小鼠尾静脉注射、颅内注射等给药操作，以及后续组织采集与核酸/蛋白提取的标准流程。
实验记录与报告撰写
按GLP规范记录实验步骤、原始数据，整理分析结果并撰写研究报告
qPCR与Western blot分析
指导临床前基因疗法研究员提取RNA和蛋白，进行实时定量PCR和免疫印迹检测基因/蛋白表达变化，支持基因编辑或载体效率评估。
基因载体构建与验证
设计并组装AAV、慢病毒等载体，进行质粒构建、酶切验证及测序分析
免疫组化与原位杂交
石蜡/冰冻切片制备，抗体孵育、DAB显色或荧光标记，图像采集分析
细胞转染与感染操作
在HEK293T、原代细胞等中执行脂质体、电转或病毒介导的转染/感染，用于基因表达调控或功能研究
测序数据分析（NGS）
处理RNA-seq、WGS等高通量测序数据，完成差异表达、突变检测及通路富集分析，支持基因疗法研发中的候选靶点筛选与疗效评估
纯化工艺中控分析
使用SEC-HPLC、SDS-PAGE、Western blot等方法监测基因治疗产品纯化各步的纯度、聚集及活性
工艺规模放大（Scale-up）
将实验室小试工艺转移至中试或生产规模，评估搅拌、通气、传质等参数的影响。
qPCR/ddPCR滴度检测
针对基因治疗工艺开发，设计引物探针，执行qPCR或数字PCR定量病毒基因组滴度，分析数据并出具报告。
质粒生产工艺开发
设计并优化质粒发酵、纯化工艺流程，包括大肠杆菌培养、裂解、层析等步骤，确保高产量、高纯度及可放大性。
工艺偏差调查与CAPA
系统化识别基因治疗生产过程中的偏差，执行根本原因分析，制定并跟踪纠正与预防措施，确保工艺稳健性与合规性。
细胞转染效率优化
系统筛选转染试剂及条件（如PEI、脂质体），提升贴壁或悬浮细胞的转染效率，适用于基因治疗工艺开发。
细胞培养与传代
规范执行HEK293、HEK293T等贴壁及悬浮细胞的复苏、传代、冻存及支原体检测，确保细胞质量与批次一致性，支持基因治疗载体生产与工艺开发。
病毒载体包被与纯化
操作HEK293细胞转染、病毒收获、超速离心及层析纯化，获得高滴度AAV或慢病毒